Die Kirche von Hettenshausen ist in ihren Ursprüngen schon sehr alt. Bereits im 8. Jahrhundert wird eine Taufkirche zu Ehren des Hl. Johannes des Täufers genannt.
Die heutige Kirche wurde in der 2. Hälfte des 15. Jahrhunderts erbaut. Eine Inschrift am Chorbogen lässt schließen, dass die Kirche im Jahr 1699 umgestaltet worden ist. Nach einer umfassenden Renovierung vor einigen Jahren präsentiert sich die Kirche als schönes helles Gotteshaus. Besondere Schmuckstücke sind zwei Bildhauerarbeiten aus dem Jahr 1510: Die Muttergottes und der Hl. Johannes.